植物根圏の微生物叢解析を行った。圃場でのサンプリングとDNAシーケンス（ミッション１）とMothurソフトウェアを用いたデータ解析（ミッション３）を融合した研究である。ダイズ根圏での微生物叢が生育段階によって変動することを明らかにした。

・研究期間：平成24年4月～平成27年3月
・関連ミッション：ミッション1、ミッション3

・研究代表者：杉山暁史
・共同研究者：上田義勝

・成果発表：
論文： Sugiyama, A., Ueda, Y., Zushi, T., Takase, H., Yazaki, K.
Changes in the bacterial community of soybean rhizospheres during growth in the field.
Plos One 9(6), e100709 (2014)

Sugiyama, A., Ueda, K., Takase, H., Yazaki, K.
Pyrosequencing assessment of rhizosphere fungal communities from a soybean field.
Can. J. Microbiol. 60(10), 687-690. (2014)

Sugiyama, A., Ueda, K., Takase, H., Yazaki, K.
Do soybeans select specific species of Bradyrhizobium during growth?
Communicative & Integrative Biology 8 (1), e992734 (2015)