木材が地層中に埋もれている間に、二酸化ケイ素をたっぷり含んだ地下水が木材組織にしみこみ、何万年もの間にセルロースなどの木材成分が失われて、樹木が原型を変えずに二酸化ケイ素（シリカ）という物質に変化したものをいいます。
展示室にある標本は、インドネシア・ジャワ島のボゴール近郊から産出したもので、地層の年代から推定すると今から160万年から500万年前のものとされています。 この標本は、組織観察によりフタバガキ科（Dipterocarpaceae）の木材であることがわかっています。

現生の木材成分（セルロース・ヘミセルロース・リグニン）を残した状態で発見された、樹木由来の遺骸である。
展示室にある標本は、黒い色をしているが、炭でも石炭でもなく材化石と呼ばれている。
これは大阪平野の地下33Ｍ、難波累層から採取されたクヌギの材化石である。
放射性炭素による年代測定の結果、およそ1万年前（10900±140yBP）のものとわかった。
このように古い地層からは材化石が出土することがあり、その時代の植生などを復元する研究試料として利用されている。